PubMed高手必会的9个技巧-连载1

   |    2018年3月24日  |   方法经验  |    0 条评论  |    1628

注:本文转自解螺旋·临床医生科研成长平台

Pubmed作为国际上公认的最具权威的生物医学文献数据库,是科研者文献搜索的重磅利器。因而为了让各位实验新手快速晋级为玩转Pubmed的科研达人,本文则将压箱底的10大绝招倾囊相授,希望能助大家一臂之力。

1.广撒网,多捞鱼

在科研课题决定之初,利用Pubmed进行充分的文献调研早已是一件家常便饭的事情,然而让人头疼是,在搜索关键词后,跳出的结果大多不是自己想要的剧情,很多与关键词不匹配的文章充斥其中,无疑加大了研究者文献筛选的工作量。

 

举个例子,打开Pubmed网页之后,在检索框中,输入Inflammatory bowel disease TNF后,点击“Search”或按Enter键,结果如下图所示。

显然,对于输入Pubmed的多词词组,它会查询词组索引,如果查到相应词组会将其作为一个检索词来检索,但如果没有查到相应词组,则会将其拆分成单个词分别检索。所以Inflammatory bowel disease TNF就相当于Inflammatory AND bowel AND disease AND TNF。

 

如果不想把词组分开咋办?方法很简单,四个锦囊妙计送给你:1)加双引号:“Inflammatory bowel disease”TNF;2)加标段标识[tw]:Inflammatory bowel disease[tw] TNF;3)加短横线:Inflammatory-bowel-disease TNF;4)加截词符*:Inflammatory bowel disease* TNF

2.查缺补漏,MeSH是“大功臣”

但是问题又来了,Inflammatory bowel disease还有一种缩略写法IBD,上面的搜索方式无疑会漏掉一些文献,而且还有一些关键词还会有很多同义词,不是一次性搜索就会全部出现的。此时,Pubmed里的一款总结同义词的利器——MeSH霸气上线了。

以liver cancer lncRNA为例,在MeSH里输入liver cancer,就会跳出主题词liver Neoplasms,这名词看上去可就高大上多了。

点击第一个主题词liver Neoplasms后,可寻找相应的副题词并进行打钩后,点击右边上的“Add to Search builder”加到你的关键词构建(PubMed Search Builder)中。这样第一条关键词就是“肝肿瘤的遗传学分析。

然后不要退出,继续输入关键词lncRNA,也通过“Addto Search builder”加到关键词构建中,这个时候需要注意的是,用“And”这种逻辑语言的话,就代表求交集了,当然还可以自主换别的逻辑语言。构建完你的关键词之后,点击了“SearchPubMed”就OK了。

3.精确检索文章

当然你要是有所针对的或特异性的搜索具体作者、杂志或者其他信息等,还可以进行更加高级的检索,点Advanced就可以了!

进去之后是个这个界面,检索之后的步骤就是一样的了:

又或者,在Pubmed的主页面中,点击Pubmed Tools中的Single Citation Matcher,进入以下界面,输入特定的杂志、日期、作者名字(第一作者或通讯作者)即可靶向某篇特定的文章。

 

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